MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 2580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	A	6	6	22	27	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000853	AAT	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000853	GAT	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000853	TAG	2	6	110	115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000853	AC	3	6	126	131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000853	CTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000853	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_000853	T	6	6	236	241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000853	GTT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000853	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000853	CT	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000853	TG	3	6	312	317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000853	ATT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000853	GGT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000853	TTA	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000853	TTGC	2	8	1193	1200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000853	AAACT	2	10	1240	1249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_000853	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000853	GAAAC	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_000853	TCA	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_000853	CGTTTC	2	12	1338	1349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000853	TCT	3	9	1387	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000853	GCCTC	2	10	1523	1532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_000853	CTA	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000853	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000853	AT	5	10	1652	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000853	TTTTGT	2	12	1662	1673	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000853	AGT	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000853	GA	4	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000853	ACG	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000853	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000853	TCTG	2	8	2129	2136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000853	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000853	TGA	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000853	TGTT	2	8	2209	2216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000853	AAT	2	6	2219	2224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000853	AAT	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000853	AAT	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000853	ACTCGA	2	12	2375	2386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000853	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000853	TCC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_000853	GTTT	2	8	2476	2483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000853	AAT	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000853	TTCTC	2	10	2535	2544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_000853	AAT	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000853	ACC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_000853	AAT	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000853	CCT	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_000853	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000853	GAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000853	TC	3	6	2939	2944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000853	AAT	2	6	2951	2956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000853	GAC	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000853	TGT	3	9	3004	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000853	GTTT	2	8	3072	3079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000853	A	8	8	3101	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000853	G	6	6	3125	3130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000853	CCT	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_000853	CGG	2	6	8192	8197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_000853	T	7	7	11401	11407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000853	ATG	2	6	11448	11453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000853	AAAAG	2	10	11454	11463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000853	TGT	2	6	13222	13227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000853	GAG	2	6	13229	13234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000853	AGG	2	6	15317	15322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000853	CGGG	2	8	16308	16315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000853	A	7	7	19379	19385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000853	T	6	6	19406	19411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000853	TC	3	6	21405	21410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000853	CCT	2	6	31301	31306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_000853	TCC	2	6	32477	32482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_000853	CTT	2	6	32485	32490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000853	ATCT	2	8	32491	32498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_000853	AGAA	2	8	32504	32511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000853	T	6	6	32557	32562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000853	ATT	2	6	32586	32591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000853	GAA	2	6	32687	32692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000853	TG	3	6	32693	32698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000853	A	6	6	32703	32708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000853	T	6	6	32759	32764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000853	ACA	2	6	32774	32779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000853	AG	3	6	34052	34057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000853	CTG	2	6	34060	34065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_000853	CT	3	6	34068	34073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000853	A	6	6	34085	34090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000853	GAG	2	6	35208	35213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000853	A	6	6	35225	35230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000853	TTTTG	2	10	44413	44422	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000853	AT	3	6	47085	47090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000853	TA	3	6	47099	47104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000853	TGA	3	9	47120	47128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000853	T	6	6	47144	47149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000853	A	7	7	47163	47169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000853	TCCC	2	8	53663	53670	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_000853	CTC	2	6	57713	57718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_000853	CA	3	6	58824	58829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000853	CCT	2	6	59834	59839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_000853	CTT	2	6	59889	59894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_000853	GAAT	2	8	59896	59903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000853	ATT	2	6	59977	59982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000853	AAT	2	6	60024	60029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000853	GAA	2	6	60046	60051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000853	T	6	6	60058	60063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000853	A	6	6	60070	60075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000853	GGTT	2	8	60108	60115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000853	GT	3	6	60132	60137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000853	G	6	6	63324	63329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000853	CCT	2	6	63339	63344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_000853	TAGA	2	8	63369	63376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000853	A	6	6	63930	63935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000853	G	6	6	63952	63957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000853	C	6	6	64417	64422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_000853	TAT	3	9	65829	65837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000853	ATTG	2	8	65839	65846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000853	AGA	2	6	65854	65859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000853	GTTTTT	2	12	66637	66648	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000853	T	7	7	66644	66650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000853	AGG	2	6	66676	66681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000853	CCT	2	6	72102	72107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_000853	ATA	2	6	72129	72134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000853	A	6	6	72144	72149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000853	A	6	6	72153	72158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000853	GAA	2	6	72159	72164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000853	AAT	2	6	72182	72187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000853	A	7	7	72220	72226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000853	A	6	6	72275	72280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000853	G	6	6	74219	74224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000853	AGG	2	6	74251	74256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000853	GAG	2	6	78126	78131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000853	GGC	2	6	84237	84242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000853	GAGG	2	8	84298	84305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000853	CCT	2	6	89001	89006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_000853	T	6	6	89029	89034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000853	AGG	2	6	89048	89053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000853	CA	3	6	97475	97480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_000853	TCC	2	6	108196	108201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_000853	TCC	2	6	112905	112910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_000853	TAT	2	6	112948	112953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000853	A	6	6	115765	115770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000853	ATT	2	6	115805	115810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000853	TAAT	2	8	115820	115827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000853	ATA	2	6	115834	115839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000853	AGG	2	6	115852	115857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000853	AGG	2	6	117003	117008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000853	GGTG	2	8	119148	119155	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000853	GAG	2	6	120884	120889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000853	A	6	6	124803	124808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000853	CA	3	6	124809	124814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_000853	TGT	2	6	124818	124823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000853	AGG	2	6	124832	124837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000853	A	7	7	129928	129934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000853	GAA	2	6	129937	129942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000853	CGA	2	6	129951	129956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_000853	ATA	3	9	150463	150471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_000853	TC	3	6	153083	153088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_000853	TCC	2	6	153090	153095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_000853	TAT	2	6	156996	157001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_000853	ACC	2	6	157099	157104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_000853	GGTA	2	8	157121	157128	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_000853	GGT	2	6	157171	157176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_000853	CGA	2	6	191451	191456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_000853	GATAT	2	10	291410	291419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
424	NC_000853	GTAC	2	8	291430	291437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
425	NC_000853	G	6	6	291460	291465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_000853	AGG	2	6	294718	294723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_000853	CCG	2	6	315101	315106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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486	NC_000853	GTA	2	6	331447	331452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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